Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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