Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HADHQ16836 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HADHQ16836 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HADHQ16836 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HADHQ16836 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HADHQ16836 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HADHQ16836 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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