Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
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PTPROQ16827 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPROQ16827 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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