Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDKN3Q16667 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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