Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXNQ16595 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXNQ16595 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXNQ16595 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXNQ16595 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXNQ16595 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXNQ16595 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXNQ16595 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXNQ16595 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXNQ16595 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXNQ16595 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FXNQ16595 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FXNQ16595 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXNQ16595 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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