Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms