Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms