Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
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