Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC85BQ15834 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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