Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKIV2LQ15477 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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