Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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