Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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UBE3CQ15386 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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UBE3CQ15386 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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UBE3CQ15386 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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UBE3CQ15386 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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UBE3CQ15386 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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UBE3CQ15386 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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UBE3CQ15386 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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UBE3CQ15386 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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UBE3CQ15386 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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UBE3CQ15386 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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UBE3CQ15386 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE3CQ15386 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE3CQ15386 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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