Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5R1Q15078 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms