Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
R3HDM1Q15032 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
R3HDM1Q15032 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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