Protein–RNA interactions for Protein: Q14D33

RTP5, Receptor-transporting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP5Q14D33 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTP5Q14D33 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms