Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD4Q14839 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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