Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN1Q14699 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFTN1Q14699 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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