Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMC1AQ14683 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMC1AQ14683 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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