Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC3Q14003 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms