Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLF9Q13886 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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