Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HTR4Q13639 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms