Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TUBB3Q13509 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TUBB3Q13509 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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TUBB3Q13509 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
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TUBB3Q13509 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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TUBB3Q13509 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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TUBB3Q13509 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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TUBB3Q13509 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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TUBB3Q13509 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB3Q13509 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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