Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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