Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PMS2P3Q13401 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms