Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms