Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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NR1H3Q13133 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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NR1H3Q13133 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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NR1H3Q13133 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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NR1H3Q13133 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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