Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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CSTF3Q12996 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSTF3Q12996 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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