Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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BNIP1Q12981 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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BNIP1Q12981 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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BNIP1Q12981 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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BNIP1Q12981 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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BNIP1Q12981 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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BNIP1Q12981 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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BNIP1Q12981 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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BNIP1Q12981 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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BNIP1Q12981 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms