Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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