Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFCP2Q12800 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFCP2Q12800 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFCP2Q12800 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFCP2Q12800 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFCP2Q12800 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFCP2Q12800 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TFCP2Q12800 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFCP2Q12800 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFCP2Q12800 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms