Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CGNL1Q0VF96 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms