Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms