Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms