Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms