Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXOSC9Q06265 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms