Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AP002807.1-203ENST00000534517 664 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms