Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms