Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms