Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms