Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALDH6A1Q02252 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms