Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FGD1P98174 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FGD1P98174 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms