Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VLDLRP98155 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms