Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms