Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP107P57740 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP107P57740 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms