Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPK4P57078 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms