Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BACE1P56817 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BACE1P56817 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BACE1P56817 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BACE1P56817 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BACE1P56817 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BACE1P56817 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BACE1P56817 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BACE1P56817 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BACE1P56817 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BACE1P56817 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BACE1P56817 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BACE1P56817 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BACE1P56817 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BACE1P56817 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BACE1P56817 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms