Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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PGGT1BP53609 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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PGGT1BP53609 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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PGGT1BP53609 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGGT1BP53609 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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