Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP2P50120 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP2P50120 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP2P50120 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP2P50120 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP2P50120 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP2P50120 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP2P50120 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP2P50120 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP2P50120 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP2P50120 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP2P50120 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms