Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIA4P48058 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIA4P48058 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms