Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCR1P46094 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCR1P46094 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCR1P46094 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCR1P46094 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms